《X课程》第一季以转学生顾晓进入一所重视实验课程的中学为起点。学校新开一门代号“X”的综合课程，课程设计者程野要求学生在限定时间内完成跨学科任务，但任务单总出现奇怪改动。心理老师林墨发现部分学生因竞争压力焦虑，班长许然则暗中记录每次任务变化。顾晓在一次校园寻物任务中捡到被撕掉的课程页，发现改动与旧实验室停用有关。随着第一季推进，学生们通过图书馆检索、校园地图比对和小组讨论逐步拼出课程背后的真实目的：不是筛选优等生，而是让不同特长的学生学会合作。剧集用任务挑战、错题复盘和班级会议制造悬念与青春感，也呈现竞争与协作的拉扯。最终第一季在公开课上收束，学生们选择共同完成展示，程野也承认课程需要倾听学生。